RNA聚合酶III啟動(dòng)子的特點(diǎn)是它們通常位于基因內(nèi)部。已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了兩種類型的聚合酶III內(nèi)部啟動(dòng)子。第一種類型通常發(fā)現(xiàn)于（）基因中，它包含兩個(gè)稱為A盒和C盒的保守序列。轉(zhuǎn)錄因子（）結(jié)合于C盒上并能吸引（）因子。另一種類型的聚合酶III啟動(dòng)子是上游啟動(dòng)子，它發(fā)現(xiàn)于一些編碼（）的基因上。這些啟動(dòng)子可能具有PSE，OCT元件和（）框。因?yàn)椋ǎ┛蛞呀?jīng)足以起始轉(zhuǎn)錄，所以當(dāng)有其他元件存在，轉(zhuǎn)錄的效率就提高了。