A.ICD-9-CM-3每年進行修訂與補充，更新及時；ICPM自1978年至今未修訂
B.ICD-9-CM-3是ICPM兩卷書的合訂本，只有一個類目表和一個字母索引表
C.ICD-9-CM-3分類結構以解剖部位為主；ICPM將所有的活組織病理檢查單獨列出，歸入第一章
D.ICD-9-CM-3分類類目是以兩位數(shù)為基礎，ICPM是三位數(shù)，加上章號四位數(shù)才能與其他操作編碼區(qū)分開
E.ICPM除手術外，其余各章都以手術操作方式為軸心；ICD-9-CM-3認為ICPM的分類軸心不利于臨床使用，把分散的操作歸到解剖部位之下